En esta línea se incluyen estudios sobre el control de la reproducción en peces encaminados a la obtención predecible de puestas de alta calidad y en cantidad. Actualmente, los esfuerzos están dirigidos al estudio del control al inicio de la gametogénesis usando la lubina (Dicentrarchus labrax) como especie modelo. Estos estudios se centran en determinar el papel que tienen distintos factores de crecimiento en el control de estas fases iniciales desde las células madres germinales hasta las células germinales diferenciadas. Con estos estudios se pretende 1) la obtención de marcadores moleculares de células madre germinales indiferenciadas para su aislamiento y uso en trasplantes desde especies donantes difíciles de cultivar a especies receptoras más fáciles de cultivar, y así obtener gametos de la especie donante, y 2) poder desarrollar terapias génicas y/o hormonales que permitan inhibir o estimular el ciclo reproductor según las necesidades del acuicultor

La línea se centra en el estudio de las patologías que afectan a las especies de interés en acuicultura asociadas a procesos de cultivo y en poblaciones naturales debidos a episodios ambientales, así como el desarrollo de marcadores que permitan anticipar factores de riesgo y posibles efectos. Se estudian las principales patologías puedan tener un origen infeccioso (virus, bacterias y hongos, infestaciones por parásitos), nutricional (alimentación inadecuada o falta de nutrientes esenciales, contaminación de piensos, presencia de factores anti-nutricionales) y ambiental (condiciones de cultivo inapropiadas, altas densidades de población, temperaturas inadecuadas, calidad del agua deficiente o contaminación antrópica). Estas patologías se estudian durante las fases de desarrollo ontogénico, transición a la etapa juvenil y adulta, mediante la utilización de biomarcadores que permitan una evaluación temprana de problemas de salud y estrés.

Esta es una línea transversal que está integrada en todas las líneas descritas anteriormente y que es inherente a la investigación que desarrolla el grupo. En relación al bienestar, el objetivo general es desarrollar herramientas de análisis que permitan conocer el grado de estrés y bienestar de peces, cefalópodos y crustáceos. Esto permitirá adecuar las condiciones de cultivo de los animales para mejorar sus tasas de crecimiento y disminuir la aparición de enfermedades, entre otros beneficios. Esta investigación se basa en conocer la fisiología y endocrinología de las especies de interés, y en cómo varían en función de las variables ambientales y de mantenimiento. La sostenibilidad es un aspecto de investigación clave que afecta a organismos y sistemas de producción. Se trata de minimizar el impacto ambiental, mediante una más eficiente transferencia de materia y energía en la alimentación, y mediante la búsqueda ingredientes alternativos en la dieta que contribuya a ello